РАСЧЕТ ВЛИЯНИЯ УРОВНЯ ГОМОЗИГОТНОСТИ И ГЕНОМНОГО ИНБРИДИНГА НА ПРИЗНАКИ ЭКСТЕРЬЕРА КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА МОЛОЧНОГО НАПРАВЛЕНИЯ ПРОДУКТИВНОСТИ ДИСПЕРСИОННЫМ АНАЛИЗОМ
Аннотация и ключевые слова
Аннотация:
Цель исследований – оценить влияние уровня гомозиготности (Са) и геномного инбридинга (FROH) посредством дисперсионного анализа на признаки экстерьера. Для оценки влияния FROH использованы данные по SNP-маркерам 356 быков-производителей, далее FROH присваивался дочерям (n = 42248). FROH рассчитывали как отношение суммы всех длин паттернов гомозиготности (ROH) в миллионах пар нуклеотидов (м.п.н.) в геноме быка-производителя к общему размеру генома в м.п.н., для 29 аутосом крупного рогатого скота, перекрываемых SNPs, выраженному в процентах. Для расчета влияния инбридинга (Fх) использовали 355 быков и 42 246 дочерей, Ca по STR-маркерам 342 быков и 39 749 дочерей. Fx рассчитывали по формуле Райта – Кисловского, уровень Са – как отношение количества гомозиготных локусов к общему количеству анализируемых локусов. Для экстерьерного профиля использовалась методика Союз «Мосплем». По Fx значения p = 0,000 для большинства признаков. Наиболее выраженное влияние наблюдается на показатели по системе «А» туловище (R2 = 0,033) и общую оценку (R2 = 0,026). По STR наиболее чувствительными оказались показатели молочного типа «Б» (R2 = 0,00374) и телосложения (R2 = 0,00369), что подтверждается высокими значениями F-критерия (74,71 и 73,52 соответственно). В значениях коэффициента детерминации – сильное влияние на молочный тип и туловище; умеренное воздействие на конечности (R2 = 0,00158) и вымя (R2 = 0,00294) и минимальное влияние на статические показатели (высота, см, – R² = 0,00028). Статистическая значимость подтверждается – p < 0,0001. По SNP все показатели демонстрируют p < 0,000001, R2 показывают, что сильное влияние на показатели молочного типа (R2 = 0,030) и общую оценку (R2 = 0,030); умеренное влияние на высоту в холке (R2 = 0,023) и туловище (R2 = 0,026) и минимальное влияние на признаки постановки конечностей и параметры сосков (R2 от 0,0001 до 0,005). Полученные результаты могут быть использованы для оптимизации селекционного процесса и контроля уровня инбридинга в стаде.

Ключевые слова:
молочный скот, дисперсионный анализ, экстерьер молочного скота, геномный инбридинг, гомозиготность, FROH, Са, Fx
Список литературы

1. Абугалиев С.К. Продуктивные и экстерьерные показатели коров голштинской породы, разводимой в ТОО «СП Первомайский» // Зоотехния. 2017. № 10. С. 2–5.

2. Костомахин Н.М., Замятина Т.Г. Экстерьерные особенности и молочная продуктивность первотелок различного происхождения // Главный зоотехник. 2011. № 10. С. 13–18.

3. Прахов А.Л., Басонов О.А. Молочная продуктивность и селекционно-генетические параметры черно-пестрых коров отечественной и датской селекций // Аграрная наука. 2005. № 3. С. 22–24.

4. Лешонок О.И., Новиков А.В. Взаимосвязь экстерьера и молочной продуктивности коров-первотелок // Агропродовольственная политика России. 2014. № 4. С. 49–52.

5. Басонов О.А., Шмелева Е. Характеристика и взаимосвязь хозяйственно-полезных признаков голштинизированных коров рекордисток черно-пестрой породы Нижегородской области // Вестник Нижегородской государственной сельскохозяйственной академии. 2012. № 2. С. 23–29.

6. Чижик И.А. Конституция и экстерьер сельскохозяйственных животных. Ленинград: Колос, 1979. 376 с.

7. Овчинникова Л.Ю., Бабич Е.А. Экстерьерные особенности коров первого отела в зависимости от кровности по голштинской породе // Advances in agricultural and biological sciences. 2016. Т. 2, № 1. С. 13–18.

8. Басонов О.А., Кулаткова А.С. Взаимосвязь экстерьерных и интерьерных показателей с молочной продуктивностью коров голштинской породы // Нива Поволжья. 2023. № 2 (66). С. 2001.

9. Кахикало В.Г., Лещук Т.Л. Воспроизводительная способность черно-пестрых коров в зависимости от типа телосложения // Достижения науки и техники АПК. 2015. Т. 29, № 5. С. 80–82.

10. Гриценко С.А. Влияние линейной принадлежности и кровности по голштинской породе на показатели продуктивности бычков // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2012. № 4 (36). С. 117–119.

11. Амерханов Х.А., Каюмов Ф.Г., Герасимов Н.П., и др. Влияние генотипа и фактора кормления на продуктивность чистопородных и помесных бычков в условиях Калмыкии // Известия ТСХА. 2018. № 2. С. 86–98.

12. Тулинова О.В. Связь экстерьерной оценки с кровностью по родственным породам, участвующим в формировании генотипа животных // Вестник Ульяновской государственной сельскохозяйственной академии. 2020. № 3 (51). С. 185–191.

13. Контэ А.Ф. Генетическая изменчивость оценки телосложения коров - первотелок голштинской черно-пестрой породы разных линий // Вестник Ульяновской государственной сельскохозяйственной академии. 2021. № 3 (55). С. 191–199.

14. Контэ А.Ф. Взаимосвязь признаков экстерьера первотелок черно-пестрой породы разной линейной принадлежности // Пермский аграрный вестник. 2023. № 2 (42). С. 97–104.

15. Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and researchan update // Bioinformatics. 2012. Vol. 28. P. 2537–2539.

16. Chang C.C., Chow C.C., Tellier L., et al. Second-generation PLINK: Rising to the challenge of larger and richer datasets // GigaScience. 2015. Vol. 4, N 7.

17. Zhang L., Orloff M.S., Reber S., et al. СgaTOH: Extended approach for identifying tracts of homozygosity // PLoS ONE. 2013. Vol. 8, №. 3. P. e57772.

18. Purfield C., Berry D., McParland S., et al. Runs of homozygosity and population history in cattle // BMC Genetics. 2012. Vol. 13, N 70.

19. Смарагдов М.Г., Кудинов А.А. Полногеномная оценка инбридинга у молочного скота // Достижения науки и техники АПК. 2019. Т. 33, № 6. С. 51–53.

20. Ерохин А.И., Солдатова А.П., Филатов А.И. Инбридинг и селекция животных. М.: Агропромиздат, 1985. 157 с.

21. Янчуков И.Н., Ермилов А.Н., Ермилов А.А., и др. План селекционной племенной работы с крупным рогатым скотом АО «Московское» по племенной работе. М.: Яппи, 2020. 123 с.

22. Кобзарь А.И. Прикладная математическая статистика. М.: Физматлит, 2006. 816 с.

23. Юденков В.А. Дисперсионный анализ. Минск: Бизнесофсет, 2013. 76 с.


Войти или Создать
* Забыли пароль?