<!DOCTYPE article
PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.4 20190208//EN"
       "JATS-journalpublishing1.dtd">
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" article-type="research-article" dtd-version="1.4" xml:lang="en">
 <front>
  <journal-meta>
   <journal-id journal-id-type="publisher-id">Bulletin of KSAU</journal-id>
   <journal-title-group>
    <journal-title xml:lang="en">Bulletin of KSAU</journal-title>
    <trans-title-group xml:lang="ru">
     <trans-title>Вестник КрасГАУ</trans-title>
    </trans-title-group>
   </journal-title-group>
   <issn publication-format="print">1819-4036</issn>
  </journal-meta>
  <article-meta>
   <article-id pub-id-type="publisher-id">94139</article-id>
   <article-id pub-id-type="doi">10.36718/1819-4036-2022-12-175-180</article-id>
   <article-id pub-id-type="edn">dacrdr</article-id>
   <article-categories>
    <subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru">
     <subject>Зоотехния и ветеринария</subject>
    </subj-group>
    <subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en">
     <subject>Animal breeding and veterinary surgery</subject>
    </subj-group>
    <subj-group>
     <subject>Зоотехния и ветеринария</subject>
    </subj-group>
   </article-categories>
   <title-group>
    <article-title xml:lang="en">MOLECULAR GENETIC TESTING OF CHAR BY HYPERVARIABLE GENOME LOCI</article-title>
    <trans-title-group xml:lang="ru">
     <trans-title>МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ТЕСТИРОВАНИЕ ГОЛЬЦА ПО ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНЫМ ЛОКУСАМ ГЕНОМА</trans-title>
    </trans-title-group>
   </title-group>
   <contrib-group content-type="authors">
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Четвертакова</surname>
       <given-names>Елена Викторовна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Chetvertakova</surname>
       <given-names>Elena Viktorovna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>e-ulman@mail.ru</email>
     <bio xml:lang="ru">
      <p>доктор сельскохозяйственных наук;</p>
     </bio>
     <bio xml:lang="en">
      <p>doctor of agricultural sciences;</p>
     </bio>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-1"/>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Заделенов</surname>
       <given-names>Владимир Анатольевич</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Zadelenov</surname>
       <given-names>Vladimir Anatolyevich</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>zadelenov58@mail.ru</email>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-2"/>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Алексеева</surname>
       <given-names>Е А</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Alekseeva</surname>
       <given-names>E A</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>lexeeva0503@yandex.ru</email>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-3"/>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Заделенова</surname>
       <given-names>Анна Владимировна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Zadelenova</surname>
       <given-names>Anna Vladimirovna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Денисенко</surname>
       <given-names>Елена Александровна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Denisenko</surname>
       <given-names>Elena Aleksandrovna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
    </contrib>
   </contrib-group>
   <aff-alternatives id="aff-1">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Красноярский ГАУ</institution>
     <city>Красноярск</city>
     <country>Россия</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">Federal State Budgetary Educational Institution of Higher Education Krasnoyarsk State Agrarian University</institution>
     <city>Krasnoyarsk</city>
     <country>Russian Federation</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <aff-alternatives id="aff-2">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">Красноярский филиал Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии (ФГБНУ «ВНИРО») («НИИЭРВ»);Красноярский государственный аграрный университет (КрасГАУ)</institution>
     <city>Красноярск</city>
     <country>Россия</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">Krasnoyarsk branch of the all-Russian research Institute of fisheries and Oceanography (VNIRO») (The&quot;NIIAR&quot;)Krasnoyarsk state agrarian University (Krasgau);</institution>
     <city>Krasnoyarsk</city>
     <country>Russian Federation</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <aff-alternatives id="aff-3">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">Красноярский государственный аграрный университет </institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">Krasnoyarsk State Agrarian University</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <pub-date publication-format="print" date-type="pub" iso-8601-date="2025-03-20T10:02:11+03:00">
    <day>20</day>
    <month>03</month>
    <year>2025</year>
   </pub-date>
   <pub-date publication-format="electronic" date-type="pub" iso-8601-date="2025-03-20T10:02:11+03:00">
    <day>20</day>
    <month>03</month>
    <year>2025</year>
   </pub-date>
   <issue>12</issue>
   <fpage>175</fpage>
   <lpage>180</lpage>
   <history>
    <date date-type="received" iso-8601-date="2025-01-27T00:00:00+03:00">
     <day>27</day>
     <month>01</month>
     <year>2025</year>
    </date>
   </history>
   <self-uri xlink:href="https://vestnik.kgau.ru/en/nauka/article/94139/view">https://vestnik.kgau.ru/en/nauka/article/94139/view</self-uri>
   <abstract xml:lang="ru">
    <p>Цель работы – подтверждение видовой принадлежности гольцов, обитающих в озере Мелкое. Задачи исследования: вылов гольцов в оз. Мелкое, взятие биоматериала для ПЦР-теста, определение фрагментов ДНК, характерных для вида. Вылов гольцов проводился на оз. Мелкое бассейна реки Пясины в сентябре–октябре 2022 г. ставными жилковыми сетями с ячеей 30–55 мм, длиной 30 м и высотой в посадке 2 м на глубинах от 9 до 14 м. Время экспозиции 12 часов. Температура воды – 6–7 °С. Биоматериал (мышцы хребта) в количестве семи образцов (в двух повторностях) был зафиксирован в 95 %-м этаноле, реакция проводилась в лаборатории АО «Красноярскагроплем». Перед выделением ДНК мышечную ткань вымачивали в буферном растворе трис-гидрохлорида. Для выделения ДНК из образцов биоматериала использовали набор реагентов «Экстран-2» производства фирмы ООО «НПФ Синтол», Россия. Для получения ISSR-фрагментов ДНК были использованы микросателлитные инвертированные праймеры (CTC)6G – CTC-CTC-CTC-CTC-CTC-CTC-G; (AGC)6G – AGC-AGC-AGC-AGC-AGC-AGC-G; (GAG)6C – GAG-GAG-GAG-GAG-GAG-GAG-C;(ACC)6G – ACC-ACC-ACC-ACC-ACC-ACC-G. ПЦР проводили в режиме горячий старт – 3 мин/95 °С. Далее 35 циклов в режиме: 1 мин/94 °С – денатурация; отжиг праймеров – 1 мин/60 °С; синтез ДНК – 1 мин/72 °С; достройка – 5 мин/72 °С. Результаты молекулярно-генетического анализа свидетельствуют, что распределение длин и частота встречаемости фрагментов ДНК являются характерными признаками генома гольца. Специфическими для гольца Дрягина являются фрагменты ДНК длиной от 200 до 1050 п.н. Полученные результаты будут использованы для определения видовой систематической принадлежности гольца при внедрении в аквакультуру Красноярского края.</p>
   </abstract>
   <trans-abstract xml:lang="en">
    <p>Цель работы – подтверждение видовой принадлежности гольцов, обитающих в озере Мелкое. Задачи исследования: вылов гольцов в оз. Мелкое, взятие биоматериала для ПЦР-теста, определение фрагментов ДНК, характерных для вида. Вылов гольцов проводился на оз. Мелкое бассейна реки Пясины в сентябре–октябре 2022 г. ставными жилковыми сетями с ячеей 30–55 мм, длиной 30 м и высотой в посадке 2 м на глубинах от 9 до 14 м. Время экспозиции 12 часов. Температура воды – 6–7 °С. Биоматериал (мышцы хребта) в количестве семи образцов (в двух повторностях) был зафиксирован в 95 %-м этаноле, реакция проводилась в лаборатории АО «Красноярскагроплем». Перед выделением ДНК мышечную ткань вымачивали в буферном растворе трис-гидрохлорида. Для выделения ДНК из образцов биоматериала использовали набор реагентов «Экстран-2» производства фирмы ООО «НПФ Синтол», Россия. Для получения ISSR-фрагментов ДНК были использованы микросателлитные инвертированные праймеры (CTC)6G – CTC-CTC-CTC-CTC-CTC-CTC-G; (AGC)6G – AGC-AGC-AGC-AGC-AGC-AGC-G; (GAG)6C – GAG-GAG-GAG-GAG-GAG-GAG-C;(ACC)6G – ACC-ACC-ACC-ACC-ACC-ACC-G. ПЦР проводили в режиме горячий старт – 3 мин/95 °С. Далее 35 циклов в режиме: 1 мин/94 °С – денатурация; отжиг праймеров – 1 мин/60 °С; синтез ДНК – 1 мин/72 °С; достройка – 5 мин/72 °С. Результаты молекулярно-генетического анализа свидетельствуют, что распределение длин и частота встречаемости фрагментов ДНК являются характерными признаками генома гольца. Специфическими для гольца Дрягина являются фрагменты ДНК длиной от 200 до 1050 п.н. Полученные результаты будут использованы для определения видовой систематической принадлежности гольца при внедрении в аквакультуру Красноярского края.</p>
   </trans-abstract>
   <kwd-group xml:lang="ru">
    <kwd>голец Дрягина</kwd>
    <kwd>Salvelinus drjagini</kwd>
    <kwd>молекулярно-генетическое тестирование</kwd>
    <kwd>геном</kwd>
    <kwd>ДНК</kwd>
    <kwd>полимеразная цепная реакция</kwd>
    <kwd>ядерная ДНК</kwd>
   </kwd-group>
   <kwd-group xml:lang="en">
    <kwd>Dryagin's char</kwd>
    <kwd>Salvelinus drjagini</kwd>
    <kwd>molecular genetic testing</kwd>
    <kwd>genome</kwd>
    <kwd>DNA</kwd>
    <kwd>polymerase chain reaction</kwd>
    <kwd>nuclear DNA</kwd>
   </kwd-group>
   <funding-group>
    <funding-statement xml:lang="ru">работа выполнена при поддержке Краевого государственного автономного учреждения «Красноярский краевой фонд поддержки научной и научно-технической деятельности» в рамках выполнения научных исследований и разработок по проекту «Разработка технологии формирования ремонтно-маточных стад ценных видов рыб для их введения в аквакультуру». Код заявки: 2022020408041.</funding-statement>
    <funding-statement xml:lang="en">the work has been supported by the Krasnoyarsk Regional State Autonomous Institution &quot;Krasnoyarsk Regional Foundation for the Support of Scientific and Scientific and Technical Activities&quot; as part of research and development under the project &quot;Development of technology for the formation of brood stocks of valuable fish species for their introduction into aquaculture.&quot; Application code: 2022020408041.</funding-statement>
   </funding-group>
  </article-meta>
 </front>
 <body>
  <p>Введение. Современный этап развития аквакультуры характеризуется поиском перспективных видов рыб, обладающих высокой пищевой ценностью, для внедрения в аквакультуру. В Красноярском крае к таким рыбам относятся представители осетровых и лососевых.Из семейства лососевых наибольший интерес представляет голец, формирующий множество пресноводных и анадромных (миграционных) видов, объединенных родовым именем Salvelinus. Независимо от образа жизни и биологических особенностей все виды гольца являются источником красной икры и мяса с повышенной пищевой ценностью [1].Среди озерно-речных гольцов выделяется голец Дрягина (Salvelinus drjagini). Впервые как вид эта форма гольца описана М.В. Логашевым в 1940 г. [2]. Он отличается от других видов (форм) крупными размерами и массой до 16 кг, что делает его привлекательным для введения в аквакультуру (рис. 1).   Рис. 1. Голец Дрягина (фото авторов)  Как отмечалось выше, среди гольцов отмечается много видов и форм, что требует идентификации выловленных рыб при внедрении в аквакультуру [3].Метод молекулярного тестирования по гипервариабельным локусам генома широко используется для выявления видовой и внутривидовой генетической изменчивости, идентификации популяций, пород, типов и линий животных вплоть до индивидуального генотипирования [4–7].Цель исследования – подтверждение видовой принадлежности гольцов, обитающих в озере Мелкое.Задачи: вылов гольцов в оз. Мелкое; взятие биоматериала для ПЦР-теста; определение фрагментов ДНК, характерных для вида.Материалы и методы. Отлов гольцов проводился на оз. Мелкое  бассейна реки Пясины в сентябре-октябре 2022 г. (рис. 2). Отлавливали ставными жилковыми сетями ячеей 30–55 мм, длиной 30 м и высотой в посадке 2 м на глубинах от 9 до 14 м. Время экспозиции 12 ч. Температура воды – 6–7 °С.    Рис. 2. Географическое положение озера Мелкое  Для проб был взят биоматериал (мышцы хребта) в количестве семи образцов (в двух повторностях), его фиксировали в 95 %-м этаноле. Исследование биоматериала было проведено в г. Красноярске в лаборатории определения качества молока и иммуногенетики АО «Красноярскагроплем».Перед выделением ДНК мышечную ткань вымачивали в буферном растворе трис-гидрохлорида. Для выделения ДНК из образцов был использован набор реагентов «Экстран-2» производства фирмы ООО «НПФ Синтол», Россия. В протокол выделения входило: 1) внесение образцов; 2) лизис клеток; 3) осаждение белков; 4) осаждение ДНК; 5) промывка и растворение ДНК. Хранили выделенную ядерную ДНК при температуре минус 20 °С.При проведении ISSR-анализа был использован ряд олигонуклеотидных праймеров (затравок) для синтеза фрагментов ДНК. Праймеры представляли собой различные последовательности микросателлитов:(CTC)6G – CTC-CTC-CTC-CTC-CTC-CTC-G;(AGC)6G – AGC-AGC-AGC-AGC-AGC-AGC-G;(GAG)6C – GAG-GAG-GAG-GAG-GAG-GAG-C;(ACC)6G – ACC-ACC-ACC-ACC-ACC-ACC-G.Были поставлены четыре варианта реакций ПЦР. В реакционную смесь добавляли один из вышеуказанных олигонуклеотидов, который служил в качестве прямого и обратного (инвертированного) праймера. В каждом случае были обнаружены в геноме и синтезированы локусы ДНК, находящиеся между указанными микросателлитными последовательностями.ПЦР проводили в режиме горячий старт – 3 мин/95 °С. Далее 35 циклов в режиме: денатурация – 1 мин/94 °С; отжиг праймеров – 1 мин/60 °С; синтез ДНК –1 мин/72 °С; достройка – 5 мин/72 °С.В результате ПЦР было амплифицировано большое число фрагментов. Разделение продуктов амплификации ДНК проводили в 2,5 % агарозном геле в присутствии интеркалирующего флуоресцентного красителя этидиум бромида (C21H20BrN3). Результаты реакции визуализировали в УФ-свете с использованием тест-системы «Bio-Rad» и документировали в электронном виде. Межмикросателлитные локусы ДНК представлены на электрофореграмме дискретными полосами (ISSR-фингерпринтинг). Длины фрагментов рассчитывали с помощью компьютерного анализа с использованием программы «MS Excel» и маркера длин ДНК 100 bp + 1,5 Kb + 3 Kb (НПО «Сибэнзим») в качестве референта.Результаты и их обсуждение. Методом ПЦР с использованием микросателлитных праймеров (СТС)6G, (AGC)6G, (GAG)6C, (ACC)6G были исследованы пробы мышечной ткани семи особей гольца. По результатам электрофоретического разделения фрагментов в агарозном геле наибольшее количество фрагментов ДНК было получено с использованием микросателлитного тринуклеотидного праймера (AGC)6G.В результате генетического анализа с помощью праймера (AGC)6G у семи особей были зарегистрированы на электронных снимках всего 35 фрагментов длиной от 200 до 2000 п.н., визуально различимых и формирующих выраженные пики при компьютерном сканировании гелей (рис. 3).    Рис. 3. Межмикросателлитные фрагменты ДНК гольца (на дорожке 8 (справа) находится маркер длин ДНК 100 bp + 1,5 Kb + 3 Kb (НПО «Сибэнзим»)  Во всех образцах встречаются семь маркерных фрагментов ДНК длиной от 200 до 1000 п.н. Распределение длин маркерных фрагментов приведено в таблице. Распределение длин маркерных ISSR-фрагментов ДНК у гольца Интервал длин фрагментовКоличество фрагментовДлина фрагментов1000–110011050700–6002660,700500–4001450200–3003200, 260, 300  Распределение длин и частота встречаемости фрагментов ДНК являются характеристикой генома гольца.Заключение. Для получения ISSR-фрагментов ДНК были использованы микросателлитные инвертированные праймеры, которые позволяют амплифицировать участки ДНК, расположенные между микросателлитными повторами. Метод анализа полиморфизма межмикросателлитных участков ДНК, основанный на полимеразной цепной реакции, позволил охарактеризовать множественные локусы генома гольца.Полученные результаты молекулярно-генетического анализа представленных образцов мышечной ткани хребта гольцов свидетельствуют о том, что распределение длин и частота встречаемости фрагментов ДНК являются характерными признаками генома гольца.Специфическими для гольца Дрягина являются фрагменты ДНК длиной от 200 до 1050 п.н.Полученные результаты будут использованы для определения видовой систематической принадлежности гольца при внедрении в аквакультуру Красноярского края.</p>
 </body>
 <back>
  <ref-list>
   <ref id="B1">
    <label>1.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Генетическая структура популяций северных оленей о. Колгуев Ненецкого автономного округа / Т.М. Романенко [и др.] // Достижение науки и техники АПК. 2014. №. 4. С. 68–70.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Geneticheskaya struktura populyaciy severnyh oleney o. Kolguev Neneckogo avtonomnogo okruga / T.M. Romanenko [i dr.] // Dostizhenie nauki i tehniki APK. 2014. №. 4. S. 68–70.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B2">
    <label>2.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Голец Дрягина Salvelinus Drjagini Logaschev озера Собачьего (плато Путорана) / В.А. Заделенов [и др.] // Рыболовство и рыбное хозяйство. 2022. № 10. С. 661–672.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Golec Dryagina Salvelinus Drjagini Logaschev ozera Sobach'ego (plato Putorana) / V.A. Zadelenov [i dr.] // Rybolovstvo i rybnoe hozyaystvo. 2022. № 10. S. 661–672.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B3">
    <label>3.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Жвакина А.Р., Ельсукова И.А., Легкобит А.П. Анализ аллелофонда кроликов отечественных пород методом ISSR-PCR // Достижение науки и техники АПК. 2016. Т. 30, № 1. С. 72–74.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Zhvakina A.R., El'sukova I.A., Legkobit A.P. Analiz allelofonda krolikov otechestvennyh porod metodom ISSR-PCR // Dostizhenie nauki i tehniki APK. 2016. T. 30, № 1. S. 72–74.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B4">
    <label>4.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Кол Н.В., Лазебный О.Е. Полиморфизм ISSR-PCR-маркеров в тувинской популяции северного оленя // Генетика. 2006. Т. 42. С. 1731–1734.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Kol N.V., Lazebnyy O.E. Polimorfizm ISSR-PCR-markerov v tuvinskoy populyacii severnogo olenya // Genetika. 2006. T. 42. S. 1731–1734.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B5">
    <label>5.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Логашев М.В. Озеро Мелкое и его рыбохозяйственное использование // Тр. Института полярного земледелия, животноводства и промыслового хозяйства. Сер. Промысловое хозяйство. 1940. № 11. С. 7–72.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Logashev M.V. Ozero Melkoe i ego rybohozyaystvennoe ispol'zovanie // Tr. Instituta polyarnogo zemledeliya, zhivotnovodstva i promyslovogo hozyaystva. Ser. Promyslovoe hozyaystvo. 1940. № 11. S. 7–72.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B6">
    <label>6.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Тимошкина Н.Н., Водолажский Д.И., Усатов А.В. Молекулярно-генетические маркеры в исследовании внутри- и межвидового полиморфизма осетровых рыб (Acipenseriformes) // Экологическая генетика. 2010. Т. 8. №. 1. С. 12–24.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Timoshkina N.N., Vodolazhskiy D.I., Usatov A.V. Molekulyarno-geneticheskie markery v issledovanii vnutri- i mezhvidovogo polimorfizma osetrovyh ryb (Acipenseriformes) // Ekologicheskaya genetika. 2010. T. 8. №. 1. S. 12–24.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B7">
    <label>7.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Hartley S.E., Davidson W.S. Distribution of satellite DNA sequences isolated from Arctic char, Salvelinus alpinus, in the genus Salvelinus // Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 1994. Т. 51, № S1. С. 277–283.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Hartley S.E., Davidson W.S. Distribution of satellite DNA sequences isolated from Arctic char, Salvelinus alpinus, in the genus Salvelinus // Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 1994. T. 51, № S1. S. 277–283.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
  </ref-list>
 </back>
</article>
